network-analysis

将生物网络表示为图并进行分析，涵盖邻接矩阵与关联矩阵、邻接表、有向图、带符号图及超图表示法，以及度中心性、接近中心性和介数中心性、最短路径、连通分量、前馈环与反馈环、相对于随机网络的模体富集分析，并结合数据溯源的网络医学与系统医学方法。适用于以下场景：“构建邻接矩阵”、“哪些节点是枢纽节点”、“在调控网络中查找前馈环”、“该模体是否显著富集”、“将反应表示为超图”、“针对该疾病的网络医学方法”、“追踪网络数据的溯源信息”。对于质量平衡的反应网络使用化学计量网络（stoichiometric-networks），对矩阵运算使用线性代数网络（linear-algebra-networks），对网络上的布尔动力学使用随机离散模型（stochastic-discrete-models）。

模型生成摘要（rules/v1 · 2026-11-15 15:19）：将生物网络表示为图并进行分析，涵盖邻接矩阵与关联矩阵、邻接表、有向图、带符号图及超图表示法，以及度中心性、接近中心性和介数中心性、最短路径、连通分量、前馈环与反馈环、相对于随机网络的模体富集分析，并结合数据溯源的网络医学与系统医学方法
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版本	存档时间	内容哈希	内容
v1	2026-11-15 15:18	3853cb99	可取

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