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homer-motif-analysis

通过HOMER对ChIP-seq/ATAC-seq峰进行从头(de novo)和已知转录因子(TF)基序富集分析。findMotifsGenome.pl用于发现相对于背景序列的过度表达模式;annotatePeaks.pl用于标注峰的位置上下文(如转录起始位点距离、邻近基因、重复序列等)。在MACS3分析后使用,以识别富集的转录因子、将峰注释到最近基因,并通过目标基序验证ChIP-seq结果。

模型生成摘要(rules/v1 · 2026-11-15 03:20):通过HOMER对ChIP-seq/ATAC-seq峰进行从头(de novo)和已知转录因子(TF)基序富集分析
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