single-cell-rnaseq-analysis

当处理单细胞 RNA-seq 数据（.h5ad/10X/CSV）需做质控、归一化、降维聚类、找 marker 基因与可视化时使用；用 Scanpy/AnnData 跑标准探索流程并产出 UMAP/聚类/细胞类型注释与处理后 .h5ad；不适用于深度学习概率模型（用 scvi-tools）、跨条件严谨差异表达（先 pseudobulk 再用 pydeseq2）；触发词：单细胞、scRNA-seq、scanpy、anndata、UMAP、聚类、marker 基因、细胞类型注释

模型生成摘要（rules/v1 · 2026-11-15 01:19）：当处理单细胞 RNA-seq 数据（
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版本	存档时间	内容哈希	内容
v1	2026-11-15 01:18	ee72f029	可取

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