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alterlab-pathml

使用 PathML 运行完整的计算病理学工作流——支持 160 多种切片格式的全切片图像(WSI)分析、多重免疫荧光(CODEX、Vectra、MERFISH)、细胞核分割/分类(HoVer-Net、HACTNet)、组织和细胞图构建、HDF5 数据集管理,以及在病理数据上训练深度学习模型。适用于用户构建端到端的深度学习病理分析流程、分析多重或空间蛋白质组学切片,或进行细胞核分割的场景。若仅需轻量级的 H&E 切片预处理、组织掩膜生成或简单的随机/网格/评分瓦片提取,建议使用 alterlab-histolab。属于 AlterLab 学术技能套件的一部分。

模型生成摘要(rules/v1 · 2026-11-14 00:52):使用 PathML 运行完整的计算病理学工作流——支持 160 多种切片格式的全切片图像(WSI)分析、多重免疫荧光(CODEX、Vectra、MERFISH)、细胞核分割/分类(HoVer-Net、HACTNet)、组织和细胞图构建、HD…
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