muon-multiomics-singlecell

使用 muon/MuData 进行多模态单细胞分析。适用于联合 RNA+ATAC（10x Multiome）、CITE-seq（RNA+蛋白）以及其他多组学数据。MuData 以共享 obs 的方式存储每个模态的 AnnData 对象。支持 WNN 联合嵌入、各模态独立预处理以及 MOFA 因子分析。单模态 RNA 分析可使用 scanpy-scrna-seq；当对来自相同细胞的两种或以上组学数据进行整合分析时，应使用 muon。

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