alterlab-pysam

使用 pysam（htslib 绑定）在 Python 中读写基因组比对和变异文件 — 支持 SAM/BAM/CRAM 比对、VCF/BCF 变异以及 FASTA/FASTQ 序列，并提供区域提取和碱基级覆盖度/堆叠（pileup）功能。适用于编写 NGS 数据处理流程脚本，用于解析、过滤、索引或计算 BAM/CRAM/VCF 文件的覆盖度。属于 AlterLab 学术技能套件的一部分。

模型生成摘要（rules/v1 · 2026-11-13 01:02）：使用 pysam（htslib 绑定）在 Python 中读写基因组比对和变异文件 — 支持 SAM/BAM/CRAM 比对、VCF/BCF 变异以及 FASTA/FASTQ 序列，并提供区域提取和碱基级覆盖度/堆叠（pileup）功能
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存档时间线

版本	存档时间	内容哈希	内容
v1	2026-11-13 01:02	6efc280f	可取

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