samtools

用于宏基因组比对输出的SAM/BAM/CRAM处理——排序、建立索引、flagstat统计、覆盖度计算和过滤。在CoverM、MetaBAT2、inStrain或BASALT之前，每当比对工具生成SAM/BAM文件时使用。上游工具：https://github.com/samtools/samtools。

模型生成摘要（rules/v1 · 2026-11-13 01:00）：用于宏基因组比对输出的SAM/BAM/CRAM处理——排序、建立索引、flagstat统计、覆盖度计算和过滤
这是模型对公开材料的总结，不是官方声明，请以原链内容为准。

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版本	存档时间	内容哈希	内容
v1	2026-11-13 01:00	db15b8cd	可取

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