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polars-bio-genomic-intervals

当在 Polars DataFrame 上进行基因组区间运算(如重叠 overlap、最近邻 nearest、合并 merge、覆盖 coverage、补集 complement、差集 subtract)或读写 BED/VCF/BAM/GFF 等生物信息学格式,且数据量较大需支持流式处理或云端计算时使用;适用于区间算术、生信文件输入输出、DataFusion SQL 查询、BAM 测序深度(depth)计算等场景,输出结果为 LazyFrame 或 DataFrame。不适用于纯序列比对、变异注释或非基于区间的分析任务。触发关键词:基因组区间、overlap、bioframe 替代、BED/VCF/BAM、测序深度 depth

模型生成摘要(rules/v1 · 2026-11-12 17:18):当在 Polars DataFrame 上进行基因组区间运算(如重叠 overlap、最近邻 nearest、合并 merge、覆盖 coverage、补集 complement、差集 subtract)或读写 BED/VCF/BAM/GF…
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